Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF35P13682 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF35P13682 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF35P13682 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms