Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL4P12829 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL4P12829 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL4P12829 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL4P12829 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL4P12829 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL4P12829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL4P12829 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL4P12829 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL4P12829 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL4P12829 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL4P12829 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL4P12829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL4P12829 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL4P12829 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL4P12829 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL4P12829 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL4P12829 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL4P12829 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL4P12829 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL4P12829 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL4P12829 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL4P12829 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL4P12829 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL4P12829 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL4P12829 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL4P12829 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL4P12829 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL4P12829 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL4P12829 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL4P12829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL4P12829 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL4P12829 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL4P12829 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL4P12829 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL4P12829 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL4P12829 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL4P12829 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL4P12829 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL4P12829 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL4P12829 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL4P12829 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL4P12829 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL4P12829 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL4P12829 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL4P12829 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL4P12829 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL4P12829 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL4P12829 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL4P12829 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms