Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA5P08648 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA5P08648 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms