Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFRP08138 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFRP08138 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFRP08138 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFRP08138 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFRP08138 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFRP08138 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFRP08138 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NGFRP08138 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFRP08138 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFRP08138 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NGFRP08138 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NGFRP08138 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGFRP08138 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGFRP08138 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGFRP08138 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NGFRP08138 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NGFRP08138 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NGFRP08138 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NGFRP08138 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NGFRP08138 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFRP08138 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFRP08138 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFRP08138 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NGFRP08138 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NGFRP08138 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NGFRP08138 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NGFRP08138 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NGFRP08138 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NGFRP08138 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NGFRP08138 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NGFRP08138 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NGFRP08138 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NGFRP08138 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NGFRP08138 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NGFRP08138 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NGFRP08138 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NGFRP08138 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NGFRP08138 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NGFRP08138 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NGFRP08138 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NGFRP08138 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NGFRP08138 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NGFRP08138 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NGFRP08138 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NGFRP08138 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NGFRP08138 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NGFRP08138 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NGFRP08138 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NGFRP08138 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NGFRP08138 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NGFRP08138 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NGFRP08138 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NGFRP08138 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NGFRP08138 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NGFRP08138 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NGFRP08138 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms