Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB1P08034 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB1P08034 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJB1P08034 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB1P08034 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB1P08034 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB1P08034 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB1P08034 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB1P08034 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB1P08034 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB1P08034 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB1P08034 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB1P08034 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GJB1P08034 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB1P08034 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB1P08034 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB1P08034 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB1P08034 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB1P08034 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB1P08034 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB1P08034 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB1P08034 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB1P08034 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB1P08034 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB1P08034 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB1P08034 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB1P08034 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB1P08034 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB1P08034 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB1P08034 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB1P08034 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB1P08034 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB1P08034 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB1P08034 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB1P08034 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB1P08034 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB1P08034 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJB1P08034 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJB1P08034 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB1P08034 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB1P08034 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB1P08034 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB1P08034 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB1P08034 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB1P08034 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB1P08034 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB1P08034 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB1P08034 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB1P08034 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB1P08034 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB1P08034 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB1P08034 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB1P08034 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB1P08034 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB1P08034 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB1P08034 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB1P08034 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB1P08034 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB1P08034 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB1P08034 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms