Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3P05106 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB3P05106 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms