Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-11P04433 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms