Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX6O95947 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX6O95947 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX6O95947 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX6O95947 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX6O95947 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX6O95947 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX6O95947 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX6O95947 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX6O95947 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX6O95947 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX6O95947 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX6O95947 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX6O95947 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBX6O95947 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBX6O95947 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX6O95947 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX6O95947 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX6O95947 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX6O95947 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX6O95947 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX6O95947 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX6O95947 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX6O95947 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX6O95947 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX6O95947 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX6O95947 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX6O95947 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX6O95947 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX6O95947 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX6O95947 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX6O95947 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX6O95947 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX6O95947 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX6O95947 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX6O95947 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TBX6O95947 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms