Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJB5O95377 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB5O95377 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB5O95377 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB5O95377 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB5O95377 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB5O95377 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB5O95377 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB5O95377 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB5O95377 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB5O95377 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB5O95377 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB5O95377 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB5O95377 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB5O95377 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB5O95377 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB5O95377 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB5O95377 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB5O95377 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB5O95377 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB5O95377 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB5O95377 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB5O95377 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB5O95377 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB5O95377 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB5O95377 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB5O95377 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB5O95377 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB5O95377 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB5O95377 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB5O95377 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB5O95377 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB5O95377 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB5O95377 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB5O95377 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB5O95377 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB5O95377 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB5O95377 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB5O95377 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB5O95377 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB5O95377 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB5O95377 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB5O95377 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB5O95377 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB5O95377 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB5O95377 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB5O95377 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB5O95377 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB5O95377 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB5O95377 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB5O95377 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB5O95377 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB5O95377 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB5O95377 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms