Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPB7O75200 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB7O75200 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 547.3 ms