Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MITFO75030 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MITFO75030 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MITFO75030 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MITFO75030 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MITFO75030 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MITFO75030 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MITFO75030 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MITFO75030 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MITFO75030 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MITFO75030 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MITFO75030 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MITFO75030 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MITFO75030 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MITFO75030 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MITFO75030 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MITFO75030 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MITFO75030 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MITFO75030 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MITFO75030 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MITFO75030 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MITFO75030 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MITFO75030 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MITFO75030 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MITFO75030 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MITFO75030 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MITFO75030 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MITFO75030 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MITFO75030 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MITFO75030 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MITFO75030 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MITFO75030 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MITFO75030 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MITFO75030 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms