Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEMFO60524 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEMFO60524 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEMFO60524 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEMFO60524 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEMFO60524 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEMFO60524 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEMFO60524 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEMFO60524 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEMFO60524 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEMFO60524 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEMFO60524 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEMFO60524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEMFO60524 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEMFO60524 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NEMFO60524 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEMFO60524 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEMFO60524 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEMFO60524 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NEMFO60524 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NEMFO60524 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEMFO60524 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEMFO60524 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMFO60524 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMFO60524 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMFO60524 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMFO60524 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMFO60524 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMFO60524 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMFO60524 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMFO60524 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEMFO60524 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEMFO60524 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEMFO60524 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEMFO60524 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEMFO60524 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEMFO60524 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEMFO60524 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEMFO60524 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEMFO60524 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEMFO60524 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEMFO60524 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEMFO60524 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEMFO60524 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEMFO60524 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEMFO60524 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMFO60524 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMFO60524 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMFO60524 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMFO60524 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMFO60524 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMFO60524 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMFO60524 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEMFO60524 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEMFO60524 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEMFO60524 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEMFO60524 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEMFO60524 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms