Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX3O60493 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX3O60493 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX3O60493 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX3O60493 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX3O60493 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX3O60493 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX3O60493 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX3O60493 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX3O60493 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX3O60493 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX3O60493 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX3O60493 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX3O60493 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX3O60493 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX3O60493 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX3O60493 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX3O60493 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX3O60493 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX3O60493 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX3O60493 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX3O60493 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX3O60493 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX3O60493 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX3O60493 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX3O60493 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX3O60493 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX3O60493 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX3O60493 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX3O60493 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX3O60493 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX3O60493 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX3O60493 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX3O60493 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX3O60493 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX3O60493 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX3O60493 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms