Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM1AO60341 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM1AO60341 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms