Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCMT2O60294 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms