Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKNO60260 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKNO60260 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKNO60260 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKNO60260 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKNO60260 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKNO60260 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKNO60260 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKNO60260 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKNO60260 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKNO60260 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKNO60260 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKNO60260 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKNO60260 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKNO60260 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKNO60260 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKNO60260 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKNO60260 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKNO60260 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKNO60260 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKNO60260 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKNO60260 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKNO60260 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKNO60260 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKNO60260 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKNO60260 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKNO60260 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKNO60260 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKNO60260 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKNO60260 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKNO60260 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKNO60260 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKNO60260 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKNO60260 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKNO60260 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKNO60260 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKNO60260 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKNO60260 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKNO60260 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKNO60260 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKNO60260 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKNO60260 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKNO60260 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKNO60260 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKNO60260 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKNO60260 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKNO60260 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKNO60260 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKNO60260 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKNO60260 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKNO60260 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKNO60260 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKNO60260 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKNO60260 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKNO60260 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKNO60260 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKNO60260 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms