Protein–RNA interactions for Protein: O00168

FXYD1, Phospholemman, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD1O00168 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FXYD1O00168 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXYD1O00168 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms