Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
hCG_1984214I3L0E3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
hCG_1984214I3L0E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.56■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
hCG_1984214I3L0E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
hCG_1984214I3L0E3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
hCG_1984214I3L0E3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
hCG_1984214I3L0E3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
hCG_1984214I3L0E3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
hCG_1984214I3L0E3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms