Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms