Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4D1N5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4D1N5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A4D1N5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4D1N5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4D1N5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A4D1N5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4D1N5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4D1N5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4D1N5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4D1N5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4D1N5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4D1N5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4D1N5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms