Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC24A2A3L6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC24A2A3L6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.5 ms