Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCRBV5S2A0A599 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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TCRBV5S2A0A599 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCRBV5S2A0A599 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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