Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GTF3C3Q9Y5Q9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms