Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD3Q9Y3P4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD3Q9Y3P4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD3Q9Y3P4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD3Q9Y3P4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHBDD3Q9Y3P4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms