Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LEMD3Q9Y2U8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LEMD3Q9Y2U8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LEMD3Q9Y2U8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms