Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASF1AQ9Y294 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1AQ9Y294 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1AQ9Y294 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms