Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPSEQ9Y251 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPSEQ9Y251 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPSEQ9Y251 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms