Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN6Q9UQ52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNTN6Q9UQ52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN6Q9UQ52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms