Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEU3Q9UQ49 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEU3Q9UQ49 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms