Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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