Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA1Q9UIW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA1Q9UIW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA1Q9UIW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms