Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN2Q9UHV9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PFDN2Q9UHV9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN2Q9UHV9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN2Q9UHV9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN2Q9UHV9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN2Q9UHV9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN2Q9UHV9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms