Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX25Q9UHL0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX25Q9UHL0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms