Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCHIP1Q9P0W5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCHIP1Q9P0W5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms