Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPG21Q9NZD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPG21Q9NZD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms