Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23BQ9NYZ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23BQ9NYZ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms