Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMT1Q9NXH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT1Q9NXH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms