Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECAP2Q9NVZ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECAP2Q9NVZ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms