Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLR3EQ9NVU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3EQ9NVU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms