Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVL1

FAM86C1, Protein FAM86C1, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM86C1Q9NVL1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM86C1Q9NVL1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM86C1Q9NVL1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM86C1Q9NVL1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms