Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDFIP2Q9NV92 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDFIP2Q9NV92 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NDFIP2Q9NV92 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NDFIP2Q9NV92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDFIP2Q9NV92 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDFIP2Q9NV92 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDFIP2Q9NV92 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms