Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF19Q9NS68 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF19Q9NS68 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.1 ms