Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC177Q9NQR7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC177Q9NQR7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms