Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPIFA1Q9NP55 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms