Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POPDC2Q9HBU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POPDC2Q9HBU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC2Q9HBU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC2Q9HBU9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms