Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SP110Q9HB58 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP110Q9HB58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP110Q9HB58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms