Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6CQ9H3T2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6CQ9H3T2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6CQ9H3T2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms