Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC2P3Q9BVR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HERC2P3Q9BVR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms