Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD3Q9BV44 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD3Q9BV44 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD3Q9BV44 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms