Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GINS3Q9BRX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms